結節性硬化症（けっせつせいこうかしょう）の患者さんは、 脳の症状として「てんかん」があらわれる場合があります。mTOR（エムトール）のはたらきが活発になりすぎるとてんかん発作がより強くなることが知られています。 てんかんの治療には、通常は抗てんかん薬が用いられます。一般的な抗てんかん薬が神経細胞の興奮しやすさを鎮めることにより発作をおさえるのに対し、アフィニトールは結節性硬化症（けっせつせいこうかしょう）そのものの原因である mTOR（エムトール）にはたらきかけるので、効果が発揮されるまでには時間がかかります。一般的な抗てんかん薬と同様、毎日続けて内服することが重要です。
